舍飼圈養(yǎng)波爾山羊由于營養(yǎng)比較單純，加之運動量減少，會使波爾山羊抵抗力降低而感染疾病。
因此除平時加強管理外更應(yīng)該做好防疫滅病工作，羊病防治必須堅持“預(yù)防為主”的方針，搞好環(huán)境衛(wèi)生，定期消毒，開展防疫檢疫，定期驅(qū)蟲，具體的操作有以下幾點：
（一）嚴格執(zhí)行防疫制度。從引種到出售要嚴格檢疫，外地引進波爾山羊種羊要來自非疫區(qū)，外購的飼料和用具也要從安全地區(qū)購入。
（二）搞好圈舍環(huán)境衛(wèi)生。圈舍墻壁、地面、用具，應(yīng)保持清潔干燥，堅持每天清糞便墊圈，糞便污物運到妥善場地堆積發(fā)酵，開展滅蠅滅鼠防止攜帶傳播，保持飼草清潔干燥，飲水清潔無冰凍。
（三）加強飼養(yǎng)管理。堅持自繁自養(yǎng)，謹慎引入羊只，防止帶入傳染病，注意階段、各時期羊的營養(yǎng)均衡供應(yīng)，妥善安排各生產(chǎn)環(huán)節(jié)。
（四）做好波爾山羊消毒工作。消毒是貫徹“預(yù)防為主”方針的一項重要措施，其目的是消滅傳染源的傳播與外界環(huán)境中的微生物，切斷傳播途徑，阻斷疾病繼續(xù)蔓延。
（五）有計劃的給波爾山羊免疫接種。根據(jù)當(dāng)?shù)貍魅静〉牧餍星闆r在獸醫(yī)部門的指導(dǎo)下開展免疫接種，一般在每年的春季和秋季進行預(yù)防接種工作。免疫注射常用的疫苗：（1）羊三聯(lián)四防苗（2）口蹄疫病毒疫苗（3）山羊痘凍干苗。
（六）定期組織波爾山羊驅(qū)蟲。常見藥物有阿維菌素類和伊維菌素類，以及丙硫咪唑，左旋咪唑等。
（七）實施藥物預(yù)防。包括藥物、安全廉價的藥物拌料或飲水，以及微生物復(fù)合菌制劑應(yīng)用等。
（八）預(yù)防中毒。不喂霉敗飼料，不用污濁或受污染的水飼喂波爾山羊，剔除青干野草中的有毒植物。注意飼料的正確調(diào)制處理，妥善貯藏以及適當(dāng)?shù)拇钆浔壤乐共莶饲o葉上殘留的農(nóng)藥和誤食滅鼠藥中毒。